Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
PTPRMP28827 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
PTPRMP28827 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
PTPRMP28827 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
PTPRMP28827 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
PTPRMP28827 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
PTPRMP28827 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
PTPRMP28827 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
PTPRMP28827 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
PTPRMP28827 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
PTPRMP28827 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
PTPRMP28827 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
PTPRMP28827 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.24□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-4.24□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
PTPRMP28827 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
PTPRMP28827 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
PTPRMP28827 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
PTPRMP28827 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
PTPRMP28827 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
PTPRMP28827 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
PTPRMP28827 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
PTPRMP28827 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
PTPRMP28827 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
PTPRMP28827 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
PTPRMP28827 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
PTPRMP28827 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
PTPRMP28827 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
PTPRMP28827 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
PTPRMP28827 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
PTPRMP28827 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
PTPRMP28827 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
PTPRMP28827 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
PTPRMP28827 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
PTPRMP28827 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
PTPRMP28827 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
PTPRMP28827 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
PTPRMP28827 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
PTPRMP28827 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
PTPRMP28827 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
PTPRMP28827 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
PTPRMP28827 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
PTPRMP28827 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
PTPRMP28827 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
PTPRMP28827 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
PTPRMP28827 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
PTPRMP28827 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms