Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SCN9AQ15858 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SCN9AQ15858 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
SCN9AQ15858 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SCN9AQ15858 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SCN9AQ15858 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SCN9AQ15858 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SCN9AQ15858 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
SCN9AQ15858 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN9AQ15858 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SCN9AQ15858 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN9AQ15858 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SCN9AQ15858 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN9AQ15858 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SCN9AQ15858 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
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