Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
VAMP3Q15836 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
VAMP3Q15836 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
VAMP3Q15836 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
VAMP3Q15836 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.67□□□□□ -3
VAMP3Q15836 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
VAMP3Q15836 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
VAMP3Q15836 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
VAMP3Q15836 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
VAMP3Q15836 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
VAMP3Q15836 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
VAMP3Q15836 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
VAMP3Q15836 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
VAMP3Q15836 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
VAMP3Q15836 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
VAMP3Q15836 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
VAMP3Q15836 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.83□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
VAMP3Q15836 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
VAMP3Q15836 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
VAMP3Q15836 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
VAMP3Q15836 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
VAMP3Q15836 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
VAMP3Q15836 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
VAMP3Q15836 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
VAMP3Q15836 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
VAMP3Q15836 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
VAMP3Q15836 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
VAMP3Q15836 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
VAMP3Q15836 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
VAMP3Q15836 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
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