Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PDK3Q15120 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PDK3Q15120 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PDK3Q15120 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PDK3Q15120 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PDK3Q15120 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PDK3Q15120 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PDK3Q15120 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PDK3Q15120 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
PDK3Q15120 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
PDK3Q15120 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
PDK3Q15120 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
PDK3Q15120 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
PDK3Q15120 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PDK3Q15120 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PDK3Q15120 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PDK3Q15120 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
PDK3Q15120 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PDK3Q15120 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PDK3Q15120 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PDK3Q15120 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
PDK3Q15120 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PDK3Q15120 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms