Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
MDC1Q14676 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
MDC1Q14676 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
MDC1Q14676 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
MDC1Q14676 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
MDC1Q14676 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.3 ms