Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
IRF3Q14653 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
IRF3Q14653 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
IRF3Q14653 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
IRF3Q14653 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
IRF3Q14653 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
IRF3Q14653 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
IRF3Q14653 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
IRF3Q14653 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
IRF3Q14653 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
IRF3Q14653 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
IRF3Q14653 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
IRF3Q14653 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
IRF3Q14653 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
IRF3Q14653 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.1□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.11□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
IRF3Q14653 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
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