Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SCN9AQ15858 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN9AQ15858 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
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SCN9AQ15858 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
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SCN9AQ15858 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
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SCN9AQ15858 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
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SCN9AQ15858 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SCN9AQ15858 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
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SCN9AQ15858 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
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SCN9AQ15858 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
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SCN9AQ15858 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
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SCN9AQ15858 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SCN9AQ15858 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
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