Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
CPSF1Q10570 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
CPSF1Q10570 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-4.66□□□□□ -3.16
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