Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PKHD1P08F94 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PKHD1P08F94 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
PKHD1P08F94 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PKHD1P08F94 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
PKHD1P08F94 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PKHD1P08F94 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PKHD1P08F94 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PKHD1P08F94 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PKHD1P08F94 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PKHD1P08F94 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
PKHD1P08F94 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-2.13□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
PKHD1P08F94 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
PKHD1P08F94 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PKHD1P08F94 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.22□□□□□ -2.77
PKHD1P08F94 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PKHD1P08F94 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PKHD1P08F94 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.1 ms