Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
PTPN13Q12923 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms