Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-2.84□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
ZFHX3Q15911 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
ZFHX3Q15911 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
ZFHX3Q15911 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
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