Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TOP1MTQ969P6 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TOP1MTQ969P6 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
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