Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SFT2D3Q587I9 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SFT2D3Q587I9 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SFT2D3Q587I9 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SFT2D3Q587I9 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SFT2D3Q587I9 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SFT2D3Q587I9 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SFT2D3Q587I9 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SFT2D3Q587I9 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SFT2D3Q587I9 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SFT2D3Q587I9 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
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