Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-2.67□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-2.67□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-2.69□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
ZFHX3Q15911 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.72□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
ZFHX3Q15911 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.8□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
ZFHX3Q15911 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.4 ms