Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SNX17Q15036 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SNX17Q15036 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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SNX17Q15036 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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SNX17Q15036 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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SNX17Q15036 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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SNX17Q15036 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SNX17Q15036 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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SNX17Q15036 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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SNX17Q15036 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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SNX17Q15036 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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