Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL9A3Q14050 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
COL9A3Q14050 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
COL9A3Q14050 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL9A3Q14050 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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