Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PJA2O43164 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PJA2O43164 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PJA2O43164 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PJA2O43164 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PJA2O43164 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PJA2O43164 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PJA2O43164 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PJA2O43164 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PJA2O43164 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PJA2O43164 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PJA2O43164 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PJA2O43164 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PJA2O43164 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PJA2O43164 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PJA2O43164 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PJA2O43164 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PJA2O43164 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PJA2O43164 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PJA2O43164 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PJA2O43164 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PJA2O43164 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PJA2O43164 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PJA2O43164 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PJA2O43164 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PJA2O43164 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PJA2O43164 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PJA2O43164 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PJA2O43164 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PJA2O43164 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.35
PJA2O43164 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PJA2O43164 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PJA2O43164 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PJA2O43164 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PJA2O43164 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PJA2O43164 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PJA2O43164 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PJA2O43164 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PJA2O43164 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PJA2O43164 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PJA2O43164 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PJA2O43164 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PJA2O43164 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PJA2O43164 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PJA2O43164 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PJA2O43164 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PJA2O43164 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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PJA2O43164 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PJA2O43164 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PJA2O43164 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PJA2O43164 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PJA2O43164 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PJA2O43164 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PJA2O43164 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PJA2O43164 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PJA2O43164 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
PJA2O43164 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PJA2O43164 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PJA2O43164 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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PJA2O43164 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PJA2O43164 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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PJA2O43164 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
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PJA2O43164 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PJA2O43164 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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PJA2O43164 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PJA2O43164 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PJA2O43164 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PJA2O43164 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
PJA2O43164 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PJA2O43164 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PJA2O43164 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PJA2O43164 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PJA2O43164 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PJA2O43164 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PJA2O43164 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PJA2O43164 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PJA2O43164 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PJA2O43164 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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