Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FAM53CQ9NYF3 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FAM53CQ9NYF3 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FAM53CQ9NYF3 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.8 ms