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Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1
FAM3D, Protein FAM3D, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.649-201
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103 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.246-201
ENST00000364495
108 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.568-201
ENST00000384742
113 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
MIR517B-201
ENST00000385102
67 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
RNU7-200P-201
ENST00000516105
62 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
MIR5589-201
ENST00000579442
60 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP292-201
ENST00000390974
118 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
RNU4-63P-201
ENST00000411313
118 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1211P-201
ENST00000459179
105 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
AC021146.9-201
ENST00000512503
156 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-62P-201
ENST00000516526
102 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
MIR4777-201
ENST00000583710
86 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
uc_338.19-201
ENST00000616808
99 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
MIR3914-2-201
ENST00000637339
95 nt
BASIC
-1.07
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
SNORD90-201
ENST00000391145
111 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-519P-201
ENST00000410590
108 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
MIR548Z-201
ENST00000584743
97 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
MIR4499-201
ENST00000584834
69 nt
BASIC
-1.08
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
MIR604-201
ENST00000384880
94 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
MIR548A1-201
ENST00000385041
97 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.633-201
ENST00000459107
95 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
SCARNA17-201
ENST00000516183
144 nt
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
UBL4A-207
ENST00000630530
102 nt
TSL 5
BASIC
-1.09
□□□□□ -2.58
FAM3D
Q96BQ1
SNORD33.1-201
ENST00000516213
88 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.712-201
ENST00000517011
92 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
YWHAEP3-201
ENST00000582767
121 nt
BASIC
-1.1
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.10-201
ENST00000362371
110 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
RNY4P3-201
ENST00000365254
95 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.343-201
ENST00000365354
112 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-274P-201
ENST00000459566
107 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-795P-201
ENST00000516323
103 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
SNORA18.5-201
ENST00000516616
101 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-971P-201
ENST00000516920
106 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
AC012531.4-201
ENST00000616509
177 nt
BASIC
-1.11
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
AC090617.8-201
ENST00000623339
167 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
U6.96-201
ENST00000636425
70 nt
BASIC
-1.12
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-382P-201
ENST00000365181
106 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1212P-201
ENST00000517023
104 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
AC140658.3-201
ENST00000567603
271 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
MIR6779-201
ENST00000617283
64 nt
BASIC
-1.13
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
SNORA62.4-201
ENST00000365504
151 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.464-201
ENST00000384282
110 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
SNORD64-201
ENST00000386683
67 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
TRAJ30-201
ENST00000390507
57 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
MTATP6P29-201
ENST00000415057
132 nt
BASIC
-1.14
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-431P-201
ENST00000383874
107 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-80P-201
ENST00000384195
107 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.506-201
ENST00000384494
102 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
MIR548A3-201
ENST00000385297
97 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.586-201
ENST00000391146
98 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
MIR548I1-201
ENST00000408810
149 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
SNORD18.2-201
ENST00000459604
70 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-346P-201
ENST00000516288
111 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
hsa-mir-3130-1.1-201
ENST00000579223
75 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
AC006254.2-201
ENST00000603259
279 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
U6.95-201
ENST00000636931
70 nt
BASIC
-1.15
□□□□□ -2.59
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.281-201
ENST00000364774
94 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNY1P5-201
ENST00000383890
115 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
MIR124-2-201
ENST00000385081
109 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
Z95118.1-201
ENST00000421372
247 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
snoU13.17-201
ENST00000458802
104 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
SCARNA18B-201
ENST00000458806
135 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
MIR4464-201
ENST00000580818
92 nt
BASIC
-1.16
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-208P-201
ENST00000362431
107 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.180-201
ENST00000363867
113 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-260P-201
ENST00000384092
107 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-659P-201
ENST00000516454
104 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
MIR378F-201
ENST00000578143
78 nt
BASIC
-1.17
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-824P-201
ENST00000363724
104 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
SNORD58A-201
ENST00000383875
65 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1014P-201
ENST00000383940
103 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
MIR147A-201
ENST00000385079
72 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.705-201
ENST00000516862
110 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-255P-201
ENST00000516957
105 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
AL353803.5-201
ENST00000599815
141 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
AC108676.2-201
ENST00000605225
163 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
MIR382-201
ENST00000637119
76 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1290P-201
ENST00000362957
109 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU4-32P-201
ENST00000363404
141 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.218-201
ENST00000364218
104 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1039P-201
ENST00000383931
107 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
SNORA19.1-201
ENST00000410656
129 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
AC013248.1-201
ENST00000455092
232 nt
TSL 3
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP470-201
ENST00000516463
106 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
MIR4636-201
ENST00000582271
80 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
AC020913.3-201
ENST00000594678
125 nt
TSL 3
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
MIR4773-1-201
ENST00000637203
78 nt
BASIC
-1.19
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU5F-1-201
ENST00000362507
117 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
SNORA15B-2-201
ENST00000384058
135 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
SNORA15B-1-201
ENST00000384334
135 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-972P-201
ENST00000391208
107 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
SCARNA23-201
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BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-904P-201
ENST00000516206
101 nt
BASIC
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□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-758P-201
ENST00000516292
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BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP147-201
ENST00000516493
109 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
SNORA2.1-201
ENST00000363089
137 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
SNORA33.1-201
ENST00000364957
130 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1157P-201
ENST00000384456
106 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
MIR203A-201
ENST00000384836
110 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-887P-201
ENST00000410660
100 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
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