Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
UBE3CQ15386 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
UBE3CQ15386 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
UBE3CQ15386 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
UBE3CQ15386 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
UBE3CQ15386 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
UBE3CQ15386 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
UBE3CQ15386 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
UBE3CQ15386 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
UBE3CQ15386 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
UBE3CQ15386 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
UBE3CQ15386 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE3CQ15386 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE3CQ15386 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE3CQ15386 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE3CQ15386 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE3CQ15386 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.8 ms