Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRAM2Q15035 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
TRAM2Q15035 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRAM2Q15035 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRAM2Q15035 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRAM2Q15035 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRAM2Q15035 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRAM2Q15035 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
TRAM2Q15035 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
TRAM2Q15035 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM2Q15035 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRAM2Q15035 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 331.8 ms