Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SEMA3AQ14563 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.6 ms