Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RAPGEF1Q13905 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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