Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
MKRN4PQ13434 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MKRN4PQ13434 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MKRN4PQ13434 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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