Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIGQ13278 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIGQ13278 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIGQ13278 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIGQ13278 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIGQ13278 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIGQ13278 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIGQ13278 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIGQ13278 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIGQ13278 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIGQ13278 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIGQ13278 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIGQ13278 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIGQ13278 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIGQ13278 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIGQ13278 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIGQ13278 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIGQ13278 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIGQ13278 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIGQ13278 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIGQ13278 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIGQ13278 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIGQ13278 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIGQ13278 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIGQ13278 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIGQ13278 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIGQ13278 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIGQ13278 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIGQ13278 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIGQ13278 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIGQ13278 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIGQ13278 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIGQ13278 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIGQ13278 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIGQ13278 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIGQ13278 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIGQ13278 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIGQ13278 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIGQ13278 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIGQ13278 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIGQ13278 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
RIGQ13278 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIGQ13278 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIGQ13278 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 412.3 ms