Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHRNEQ04844 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHRNEQ04844 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHRNEQ04844 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHRNEQ04844 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.9 ms