Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
RABGEF1Q9UJ41 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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