Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXQ1Q9C009 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXQ1Q9C009 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.7 ms