Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SCN9AQ15858 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SCN9AQ15858 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCN9AQ15858 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCN9AQ15858 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCN9AQ15858 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCN9AQ15858 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCN9AQ15858 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCN9AQ15858 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCN9AQ15858 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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