Protein–RNA interactions for Protein: Q14687

GSE1, Genetic suppressor element 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSE1Q14687 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GSE1Q14687 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GSE1Q14687 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GSE1Q14687 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GSE1Q14687 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GSE1Q14687 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GSE1Q14687 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GSE1Q14687 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GSE1Q14687 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
GSE1Q14687 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GSE1Q14687 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GSE1Q14687 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GSE1Q14687 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GSE1Q14687 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms