Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PDE3BQ13370 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDE3BQ13370 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PDE3BQ13370 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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