Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NR1H3Q13133 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
NR1H3Q13133 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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NR1H3Q13133 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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NR1H3Q13133 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NR1H3Q13133 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NR1H3Q13133 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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