Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.5 ms