Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RABGEF1Q9UJ41 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RABGEF1Q9UJ41 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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RABGEF1Q9UJ41 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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RABGEF1Q9UJ41 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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RABGEF1Q9UJ41 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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RABGEF1Q9UJ41 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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