Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TM6SF1Q9BZW5 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.7 ms