Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-3.88□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
C2orf88Q9BSF0 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-3.93□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-4□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
C2orf88Q9BSF0 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-4.04□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-4.06□□□□□ -3.06
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283.3 ms