Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PRRT1Q99946 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
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