Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CCDC47Q96A33 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CCDC47Q96A33 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CCDC47Q96A33 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
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