Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
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USP49Q70CQ1 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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USP49Q70CQ1 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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USP49Q70CQ1 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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USP49Q70CQ1 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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USP49Q70CQ1 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
USP49Q70CQ1 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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USP49Q70CQ1 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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USP49Q70CQ1 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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