Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ZNF239Q16600 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
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