Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAF1Q13077 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAF1Q13077 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TRAF1Q13077 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.6 ms