Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ERFP50548 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ERFP50548 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ERFP50548 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ERFP50548 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ERFP50548 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ERFP50548 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ERFP50548 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ERFP50548 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ERFP50548 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ERFP50548 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.4 ms