Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPREP23469 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPREP23469 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPREP23469 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPREP23469 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPREP23469 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPREP23469 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPREP23469 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPREP23469 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPREP23469 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPREP23469 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPREP23469 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPREP23469 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPREP23469 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPREP23469 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPREP23469 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPREP23469 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPREP23469 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPREP23469 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPREP23469 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPREP23469 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPREP23469 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPREP23469 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPREP23469 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPREP23469 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPREP23469 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPREP23469 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPREP23469 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPREP23469 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPREP23469 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPREP23469 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPREP23469 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPREP23469 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPREP23469 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPREP23469 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPREP23469 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPREP23469 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPREP23469 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPREP23469 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPREP23469 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPREP23469 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPREP23469 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPREP23469 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPREP23469 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPREP23469 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPREP23469 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPREP23469 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPREP23469 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPREP23469 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPREP23469 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPREP23469 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPREP23469 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPREP23469 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPREP23469 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPREP23469 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPREP23469 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPREP23469 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPREP23469 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPREP23469 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPREP23469 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPREP23469 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPREP23469 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PTPREP23469 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPREP23469 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPREP23469 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPREP23469 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PTPREP23469 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPREP23469 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPREP23469 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PTPREP23469 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPREP23469 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPREP23469 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPREP23469 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PTPREP23469 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPREP23469 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPREP23469 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPREP23469 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPREP23469 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPREP23469 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPREP23469 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPREP23469 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPREP23469 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PTPREP23469 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPREP23469 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPREP23469 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPREP23469 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPREP23469 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PTPREP23469 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPREP23469 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPREP23469 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPREP23469 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPREP23469 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPREP23469 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPREP23469 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPREP23469 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPREP23469 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
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