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Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1
FAM3D, Protein FAM3D, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
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Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.173-201
ENST00000363776
113 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.272-201
ENST00000364696
102 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.540-201
ENST00000384638
111 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1011P-201
ENST00000384668
107 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR9-2-201
ENST00000384838
87 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR548G-201
ENST00000408442
89 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RPS29P8-201
ENST00000445109
171 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-90P-201
ENST00000606352
106 nt
BASIC
-0.67
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR20A-201
ENST00000362279
71 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-363P-201
ENST00000362895
105 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.78-201
ENST00000362970
110 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
SNORD114-31-201
ENST00000363219
75 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.114-201
ENST00000363265
113 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
SNORD114-28-201
ENST00000363610
72 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
SNORD38.1-201
ENST00000363863
68 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.294-201
ENST00000364916
102 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.452-201
ENST00000384202
108 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR548D2-201
ENST00000384955
97 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR652-201
ENST00000385278
98 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-861P-201
ENST00000516745
106 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP66-201
ENST00000517178
101 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR4645-201
ENST00000583158
77 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
AL391099.1-201
ENST00000624635
187 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
AL512310.12-203
ENST00000640543
90 nt
BASIC
-0.68
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1244P-201
ENST00000363614
108 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-682P-201
ENST00000363843
106 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.355-201
ENST00000365462
98 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP136-201
ENST00000410906
107 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MTND3P2-201
ENST00000438452
342 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1045P-201
ENST00000516321
107 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1234P-201
ENST00000516877
103 nt
BASIC
-0.69
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-647P-201
ENST00000364243
107 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.280-201
ENST00000364765
112 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-574P-201
ENST00000384265
107 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR759-201
ENST00000390224
91 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR1263-201
ENST00000408324
86 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6ATAC11P-201
ENST00000408541
125 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
AC244090.1-201
ENST00000441884
93 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU7-120P-201
ENST00000459334
63 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
COX7A2-206
ENST00000472311
325 nt
TSL 2
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1018P-201
ENST00000516577
106 nt
BASIC
-0.7
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-151P-201
ENST00000364158
107 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-196P-201
ENST00000384315
107 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR329-2-201
ENST00000385029
84 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.662-201
ENST00000516028
97 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
SCARNA15.1-201
ENST00000516384
125 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
IGLVI-20-201
ENST00000519296
130 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
AC040936.1-201
ENST00000534543
172 nt
TSL 5
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR4696-201
ENST00000581431
70 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.778-201
ENST00000620203
90 nt
BASIC
-0.71
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-235P-201
ENST00000362644
107 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
SNORD101-201
ENST00000384027
73 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
SNORA49-201
ENST00000386157
136 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR4436A-201
ENST00000585278
85 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
MIR548O2-201
ENST00000616090
70 nt
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
G3BP1-214
ENST00000627077
114 nt
TSL 5
BASIC
-0.72
□□□□□ -2.52
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-664P-201
ENST00000362381
107 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-900P-201
ENST00000384498
102 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-466P-201
ENST00000391224
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU4ATAC9P-201
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126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
AP000676.1-201
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52 nt
BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
AP001340.1-201
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BASIC
-0.73
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
AC093726.3-201
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150 nt
BASIC
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FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.162-201
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BASIC
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□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-694P-201
ENST00000364071
147 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.344-201
ENST00000365381
112 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1130P-201
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107 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.437-201
ENST00000384113
113 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.489-201
ENST00000384410
101 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1162P-201
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104 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
AC145423.2-201
ENST00000610631
239 nt
BASIC
-0.74
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
SNORD114-14-201
ENST00000362723
75 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-409P-201
ENST00000384114
104 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.785-201
ENST00000384290
109 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.528-201
ENST00000384575
108 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
MIR216B-201
ENST00000390186
82 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
SNORA3B-201
ENST00000391305
131 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
snoU13.11-201
ENST00000459219
104 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
AC103879.1-201
ENST00000503093
255 nt
TSL 2
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
AC074198.2-201
ENST00000508153
258 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-781P-201
ENST00000516377
101 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
AP001328.1-201
ENST00000528550
176 nt
BASIC
-0.75
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.155-201
ENST00000363632
101 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.283-201
ENST00000364798
112 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
SNORD56B-201
ENST00000384713
71 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.580-201
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95 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
MIR513C-201
ENST00000401352
84 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
SNORD75.1-201
ENST00000408373
60 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-935P-201
ENST00000410371
100 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
SCARNA17.3-201
ENST00000516381
125 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1057P-201
ENST00000517162
102 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNA5SP169-201
ENST00000517268
117 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
AL442128.1-201
ENST00000615151
90 nt
BASIC
-0.76
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.36-201
ENST00000362602
112 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-200P-201
ENST00000364743
107 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1062P-201
ENST00000383908
107 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
Y_RNA.507-201
ENST00000384500
99 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
RNU6-1133P-201
ENST00000410963
100 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
AL158147.1-201
ENST00000443970
75 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
FAM3D
Q96BQ1
AC096720.1-201
ENST00000604441
183 nt
BASIC
-0.77
□□□□□ -2.53
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