Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TBR1Q16650 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TBR1Q16650 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TBR1Q16650 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TBR1Q16650 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TBR1Q16650 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TBR1Q16650 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TBR1Q16650 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
TBR1Q16650 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TBR1Q16650 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TBR1Q16650 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TBR1Q16650 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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