Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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CHD4Q14839 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CHD4Q14839 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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CHD4Q14839 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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CHD4Q14839 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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CHD4Q14839 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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CHD4Q14839 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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CHD4Q14839 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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CHD4Q14839 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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CHD4Q14839 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CHD4Q14839 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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