Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
SMCO1Q147U7 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-3.04□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-3.07□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-3.09□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SMCO1Q147U7 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SMCO1Q147U7 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SMCO1Q147U7 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
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