Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMC1AQ14683 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMC1AQ14683 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMC1AQ14683 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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