Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
DDX39BQ13838 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
DDX39BQ13838 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
DDX39BQ13838 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
DDX39BQ13838 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
DDX39BQ13838 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
DDX39BQ13838 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
DDX39BQ13838 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
DDX39BQ13838 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.2 ms