Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HDAC1Q13547 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HDAC1Q13547 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HDAC1Q13547 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 317.4 ms